pBM16A Toposmart Cloning Kit

 

 

產品信息：
組 成	YCL071-01	YCL071-02
pBM16A Vector (20ng/ml )	20ml	20ml×3
10×Toposmart	20ml	20ml×3
Control Insert	5ml	5ml
M13F Primer	0.1OD	0.1OD×3
M13R Primer	0.1OD	0.1OD×3

保存條件：-20℃保存，有效期一年。

產品介紹：

pBM16A Toposmart克隆試劑盒利用痘苗病毒的拓撲異構酶I(Topoisomerase I)的切割再連接的特點將片段克隆到載體中。不僅適用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion 和Q5等高保真DNA聚合酶擴增的平末端PCR產物，也可克隆由Taq、Tth和klenTaq等DNA聚合酶擴增的帶A尾的PCR產物。試劑盒中的pBM16A載體為線性化的質粒。可以用引物對M13F和M13R進行菌落PCR鑒定陽性克隆。

產品特點：

（1）連接反應僅需5 分鐘。

（2）適用于平末端PCR產物和帶A尾的PCR產物。

（3）載體采用了新的制備工藝，無需藍白斑篩選。

1. 克隆位點兩旁都有Smal和EcoR V酶切位點，適合單酶切鑒定。
2. 載體具有氨芐青霉素抗性。

操作步驟：

1. 連接反應

按下表，在一個0.2ml PCR 管中依次加入加完試劑后，輕輕混勻低速離心，使溶液集中在管底。

成分	體積
DNA -*片段	0.5-8µl
pBM16A Topo載體	1ml
10×Toposmart	1ml
補水至總體積	10ml

 注意：此步驟不要在低溫條件下（冰水浴）上操作。

 2. 反應溫度及片段要求

室溫下（20-30℃）放置 0-5 分鐘，然后將離心管放置在冰上。如當天不進行轉化實驗。請將連接產物置于-20℃保存。

注意：DNA-*片段的用量見下表

 

片段大小（bp）	建議用量（ng）
100-1000	20-50
1000-2000	50-100
2000-5000	100-200

 

室溫下（20-30℃）反應時間 5-30 分鐘，如果室溫較低，推薦使用 PCR 儀器控制溫度。可以設置 25℃反應 5 分鐘。如果 PCR 產物電泳檢測僅有很銳利明亮的條帶，無引物二聚體和非特異性條帶存在，可直接取 0.5-1µl PCR 產物原液進行克隆。

3. 陽性對照反應

取1µl 試劑盒提供的1kb長度的對照片段LacZ 基因α肽片段進行克隆，轉化具有α 互補功能的大腸桿菌感受態(tài)細胞（如 DH5α,*0,Mach1-T1 等）。菌液涂布在含有IPTG,X-gal 的LB 氨芐平板上，次日藍色菌落為陽性克隆，說明有片段插入，白色菌落為空載體。

4. 轉化

1.取5µl 連接產物到50-100µl 剛剛融化的感受態(tài)細胞中，輕輕混勻，冰浴2-30 分鐘。

2.42℃水浴中熱擊30 秒鐘。

3. 立刻置于冰水浴中2 分鐘。

加入300-500µl 無菌的不含抗生素的SOC 或LB，37℃，200-250rpm 振蕩培養(yǎng)60 分鐘。

注：小于 2kb 片段可以不復蘇，直接涂平板。

• 吸取200µl 菌液涂布。為了得到更多的菌落，可以先4000rpm 離心1 分鐘，去掉部分上清，用移液器輕吹菌體，充分懸浮菌液，取全部菌液涂布，然后 37℃培養(yǎng)過夜（12-16 小時）。

5. 陽性重組子的鑒定菌落 PCR

（1） 菌落PCR方法鑒定陽性克隆

① 用10ml吸頭挑選克隆至預先加有10μl無菌水或LB培養(yǎng)基的PCR管中，吹打混合。

② 25ml PCR反應體系：取2μl細菌懸液為模板、加入5μM 濃度的M13F/M13R各

1μl進行PCR擴增。

③PCR擴增條件：95℃預變性5分鐘（裂解細胞，失活核酸酶），94℃變性10秒鐘，55℃退火10秒鐘，72℃延伸（ 根據片段的大小決定延伸時間，通常每1min/1kb）X秒，30個循環(huán)，72℃后延伸5分鐘。1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果，有強烈的明顯條帶的克隆為重組體，與插入片段大小相近（M13F/M13R 引物在克隆位置的兩側，所以PCR擴增出的DNA的長度比插入片段大138bp） 可視為陽性克隆。菌落PCR方法鑒定重組子時一定要設立一個不加菌液的陰性對照。

（2） 測序：用M13F、M13R通用引物對陽性質粒進行測序分析。

pBM16A載體圖譜

 

常見問題分析

 

重組子克隆菌少，或陽性率低：

(1) 感受態(tài)效率低，使用轉化效率>5×107cfu/µg 的感受態(tài)細胞

(2) 連接反應在低溫下（如放碎冰上）操作，應該在室溫下操作。

(3) PCR 片段加入量太多或太少，按照推薦量加入。

(4) PCR 純度低，重新擴增或重新純化PCR 產物。

(5) PCR 質量低，切膠時在紫外下照射時間長，需重新制備。

(6) PCR 擴增結束后，應該再延伸5-10 分鐘，確保片段延伸*。

(7) 轉化后沒有復蘇培養(yǎng)，可以加入SOC 或LB，培養(yǎng)60分鐘。

• 克隆基因可能對宿主菌有毒性，比如某些編碼膜蛋白和 DNA 結合蛋白的基因，某些啟動子和調節(jié)序列基因，或含有倒置或串聯重復序列的基因，選用室溫過夜培養(yǎng)平板。

載體序列：

>pBM16A Topo AGTGAGTTGATTGTGTAAAACGACGGCCAGTGTCTGAGGCTCGCTTCAGTCCTGATGCTTGATATCCCGGGCGT GTCGCCCTT$$$$AAGGGCGACACGCCCGGGATATCGCGTCTGCCTGAAGTCAATACTGACGATGGTCATAGCT GTTTCCTGTCCATAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTTGATCGGCACGTAAGAGGTTCC AACTTTCACCATAATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAAGGA AGCTAAAATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCACTTATTCCGTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTCCTGTTTTTG CTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTGGGTTACATCGAACTG GATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCCAATGATGAGCACTTTTAAAGT TCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGCAACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTC AGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCATCTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGC AGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGCCAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCT AACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATCATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCA TACCAAACGACGAGCGTGACACCACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAA CTACTTACTCTAGCTTCCCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCG CTCGGCCCTTCCGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGCTCTCGCGGTATCATTG CAGCACTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGAT GAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAATGAGGGCCCAAATGTAATCA CCTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATC ACAAAAATCGATGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGA AGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAG CGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTG TGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGA CACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGA GTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAG TTACCTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTT GCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATTTTCTACCGAAGAAAGGCCCAC CCGTGAAGGTGAGCC

                                                           本產品僅供研究不用于臨床診斷

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